Crée le 11 janvier 1979, le CNDRS, établissement public comorien, dispose d’une palette d’activités très diversifiées, telles que la muséologie, la documentation et l’information du public et des spécialistes, l’archivage national, la recherche scientifique, la cartographie géologique et spatiale, l’observation du Karthala, la promotion culturelle, la diffusion et la vulgarisation des informations scientifiques, l’organisation de colloques, la production de documents, tant pour les chercheurs, que pour le public, avec une connotation pédagogique prononcée. Il constitue un pôle de référence pour tous ceux qui sont intéressés par l’histoire, la géographie, la géologie, la littérature, la traditions, la faune, la flore, la religion des Comores et l’environnement de l’archipel, dans et aux abords de l’Océan Indien, sans omettre les aspects liés à la civilisation bantoue. Pour tenir ce rôle, le CNDRS est en relation étroite avec le CICIBA (traditions orales, manuscrits), mais aussi avec des établissements supérieurs, tel l’Université d’Upssala (Suède) pour les recherches archéologiques, l’Union européenne dans le cadre de la recherche scientifique et la valorisation des plantes à parfum et aromatiques, l’Institut de Physique du Globe de Paris et l’Université des Sciences de la Terre de la Réunion, pour les activités de recherche géologique et la surveillance de l’activité du Volcan Karthala.
Aujourd'hui, doté d'une autonomie administrative, financière et de gestion ( Nouveau statut du CNDRS ), le CNDRS, qui va bientôt adopter un règlement intérieur et mettre en place un Conseil scientifique de haut niveau, entend davantage mieux prendre en compte la nécessité d’intégration organique ou fonctionnelle des différentes institutions existantes de formation et de recherche pour qu'il puisse pleinement remplir sa mission.

Ainsi, le CNDRS reste aux Comores, le principal partenaire scientifique des bailleurs et de différentes agences de développement. Il joue un rôle important dans les études et enquêtes nationales. Il a initié et/ou contribué à la conception des projets- phares de développement comme entre autres, le FADC (Fonds d'Appui au Développement Communautaire) sur financement Banque Mondiale, le Projet Sanduk (Mise en place de Mutuelle d’Epargne et de Crédit).sur Financement de l’Agence Française de Développement.
En 1996, le CNDRS a, sur un financement FNUAP, réalisé avec l’assistance technique de Macro International, la première Enquête Démographique et de Santé aux Comores (EDSC), qui a permis de recueillir des données pertinentes sur la fécondité, la planification familiale, la santé de la mère et de l’enfant, la mortalité des enfants et le SIDA. Grâce aux données de cette enquête, le pays est en train de se doter d'une politique nationale en matière de population.
Depuis 1999, le CNDRS est devenu le point focal, aux Comores, de l'Université de l’Océan Indien (UOI), Programme de coopération inter-universitaire et scientifique financé par l’Union Européenne. Ce positionnement permet à l'institution de mettre à profit les acquis de l'UOI en coopération dans le domaine de l'enseignement supérieur et de la recherche. Les activités de l'UOI se développent dans le cadre de consortiums avec des accords entre établissements de formation et de recherche et même avec le secteur privé (au niveau régional et international).
L'appui et l'encadrement institutionnel du CNDRS ont permis la mise en oeuvre d'actions formation / recherche au niveau national et la mobilité de dizaines d’étudiants, d’enseignants et chercheurs au niveau régional. Cette implication du CNDRS a permis de dynamiser la collaboration entre l'UOI, le réseau régional et le réseau national constitué par les établissements de formation et de recherche des Comores.

En 1994, les Journées de la Recherche et du Développement, ont été l’occasion de montrer davantage la place de cette institution dans la recherche scientifique du pays et l'efficacité de la politique partenariale qu'elle développe avec les institutions nationales de formation supérieure, ENES, INE (IFERE), Laboratoire des Travaux Publics qui effectuent des recherches appliquées en technologies du bâtiment, le (ou Projet Sanduk, le Programme de lutte contre le paludisme qui entreprend des recherches sur les maladies vectorielles, le Programme SIDA, Care International, l’Alliance Franco-Comorienne. De nombreux et enrichissants débats et réflexions ont eu lieu. Parmi les préoccupations et les propositions exprimées, qui étaient d'une grande diversité, se sont clairement dégagés des signes de convergence concernant certaines questions essentielles de développement.

En 1995, à l’occasion du Colloque sur les vingt ans d’indépendance, le CNDRS a réalisé un travail remarquable qui a considérablement enrichi son fonds documentaire. Une analyse sans concession des réalités socio-historiques et économiques du pays a été réalisée avec l’appui des spécialistes du développement.

Ainouddine SIDI,
Directeur